Thành phố Tuy Hòa, gồm có 12 phường và 4 xã
Thị xã Sông Cầu, gồm có 4 phường và 10 xã
Đông Hòa, gồm có 2 thị trấn (Hòa Hiệp Trung và Hòa Vinh) và 8 xã
Đồng Xuân, gồm có 1 thị trấn (La Hai) và 10 xã
Phú Hòa, gồm có 1 thị trấn (Phú Hoà) và 8 xã
Sơn Hòa, gồm có 1 thị trấn (Củng Sơn) và 13 xã
Sông Hinh, gồm có 1 thị trấn (Hai Riêng) và 10 xã
Tuy An, gồm có 1 thị trấn (Chí Thạnh) và 15 xã
Tây Hòa, gồm có 1 thị trấn (Phú Thứ) và 10 xã
Tỉnh Phú Yên có 112 đơn vị cấp xã gồm 16 phường, 8 thị trấn và 88 xã.